Državno odvjetništvo RH teretilo je Novakovića za izdavanje naredbe o miniranju HE Peruča. No sud u Beogradu odbacio je dokaz kao nevažeći
Novakoviću Srbija neće suditi za rušenje Peruče
Bivšeg zapovjednika Vojske Republike Srpske Milu Novakovića Državno odvjetništvo R Hrvatske teretilo je da je od rujna 1991. do kraja siječnja 1992. godine naredio i potom sudjelovao u miniranju i potapanju Hidroelektrane Peruča u Hrvatskoj. No Tužiteljstvo za ratne zločine Srbije odbacilo je kaznenu prijavu jer, kako navodi, nema dokaza da je Novaković sudjelovao u izdavanju naredbe za takvo što. Novaković je bio osumnjičen na osnovi audiosnimki telefonskog razgovora između Ratka Mladića i osobe za koju se sumnjalo da je Novaković i koja je prihvatila naredbu za rušenje brane. Razgovor su presrele oružane snage RH. Istražni sudac Specijalnog suda za ratne zločine u Beogradu naredio je vještačenje glasa, kojim je ustanovljeno da osumnjičeni Novaković nije sudjelovao u tom telefonskom razgovoru.