Budimir je s tadašnjim direktorom ZLZ-a Boškom Matkovićem sklopio ugovor kojim je Matkoviću uz plaću osigurana vrlo izdašna otpremnina te godišnji bonusi
Istraga protiv Budimira: Nanio je milijunsku štetu ZL Zagreb
Županijsko državno odvjetništvo u Velikoj Gorici je donijelo rješenje o provođenju istrage protiv Josipa Budimira, ekonomskog stratega HDZ-a i HSLS-a, i Boška Matkovića zbog osnovane sumnje da su počinili kaznena djela protiv gospodarstva zlouporabom povjerenja u gospodarskom poslovanju.
Budimira se tereti da je 2005. kao predsjednik Nadzornoga odbora Zračne luke Zagreb (ZLZ) s tadašnjim direktorom ZLZ-a Boškom Matkovićem sklopio ugovor kojim je Matkoviću uz plaću osigurana vrlo izdašna otpremnina te godišnji bonusi, a čije odredbe Državno odvjetništvo smatra protuzakonitima.
Na taj je način u razdoblju od 31. svibnja 2005. pa do kraja 2008. godine drugookrivljeniku isplaćeno nepripadajućih plaća i nagrada u ukupnom iznosu od oko četiri milijuna kuna, a za koji je oštećeno to društvo.
Budimiru se stavlja na teret da je potpisivanjem takvoga ugovora omogućio Matkoviću stjecanje nepripadne imovinske koristi, tj. da je kao predsjednik NO-a zloupotrijebio položaj i ovlasti, a Matkovića se sumnjiči za poticanje.