Sudio je u prvoj utakmici Svjetskog prvenstva, a Fifa ga je nagradila dijeljenjem pravde i u pretposljednjoj utakmici - duelu Brazila i Nizozemske za brončanu medalju. Yuichi Nishimura izdržao je sve kritike i uzdignuta čela otići će iz Brazila.
Japanski je sudac navukao bijes svjetske nogometne javnosti u najmanju ruku kontroverznim suđenjem utakmice otvorenja SP-a između Brazila i Hrvatske kada je dosudio nekoliko sumnjivih odluka. U prvom poluvremenu nije isključio Neymara zbog udaranja Modrića, a u nastavku je dodatno razljutio hrvatske navijače.
Sredinom drugog poluvremena 42-godišnji djelitelj pravde dosudio je penal nakon što je Lovren naslonio ruke na Freda. Potom je poništio gol Perišića zbog Olićeva prekršaja na Júliju Césaru, a sve je zaključio nedosuđivanjem prekršaja za "kockaste" na sredini terena u akciji nakon koje je Óscar postavio konačnih 3-1.
Iako više nije dobio priliku biti glavni sudac, Nishimura je zaradio dnevnicu kao četvrti sudac u utakmici Hondurasa i Ekvadora u skupini, da bi ga šef Fifine sudačke komisije Massimo Bousacca nagradio postavljanjem u sudačku četvorku u utakmici za treće mjesto.